Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Necab1Q8BG18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Necab1Q8BG18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Necab1Q8BG18 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms