Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srgap3Q812A2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Srgap3Q812A2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srgap3Q812A2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms