Protein–RNA interactions for Protein: Q80W04

Tmcc2, Transmembrane and coiled-coil domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc2Q80W04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmcc2Q80W04 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmcc2Q80W04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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