Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prrc2bQ7TPM1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prrc2bQ7TPM1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Prrc2bQ7TPM1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms