Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN99

Cpeb3, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb3Q7TN99 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cpeb3Q7TN99 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpeb3Q7TN99 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms