Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Efr3bQ6ZQ18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Efr3bQ6ZQ18 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Efr3bQ6ZQ18 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efr3bQ6ZQ18 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Efr3bQ6ZQ18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Efr3bQ6ZQ18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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Efr3bQ6ZQ18 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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Efr3bQ6ZQ18 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Efr3bQ6ZQ18 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efr3bQ6ZQ18 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efr3bQ6ZQ18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efr3bQ6ZQ18 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Efr3bQ6ZQ18 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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Efr3bQ6ZQ18 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Efr3bQ6ZQ18 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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