Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Znf653Q6YND2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Znf653Q6YND2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Znf653Q6YND2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms