Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc154Q6RUT8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc154Q6RUT8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc154Q6RUT8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms