Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC137Q6PK04 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC137Q6PK04 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC137Q6PK04 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms