Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CltbQ6IRU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CltbQ6IRU5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CltbQ6IRU5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms