Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q6GQU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q6GQU0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q6GQU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms