Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Cep170Q6A065 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Cep170Q6A065 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cep170Q6A065 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cep170Q6A065 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms