Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pkp4Q68FH0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pkp4Q68FH0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pkp4Q68FH0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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