Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab3ipQ68EF0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms