Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TsnQ62348 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TsnQ62348 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TsnQ62348 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TsnQ62348 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TsnQ62348 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TsnQ62348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms