Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sall3Q62255 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sall3Q62255 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sall3Q62255 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sall3Q62255 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms