Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AtrxQ61687 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AtrxQ61687 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AtrxQ61687 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms