Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gli3Q61602 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gli3Q61602 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gli3Q61602 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gli3Q61602 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms