Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ecm1Q61508 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ecm1Q61508 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ecm1Q61508 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms