Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cd53Q61451 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd53Q61451 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms