Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Foxd1Q61345 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxd1Q61345 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxd1Q61345 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms