Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp7Q60973 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp7Q60973 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms