Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Med13Q5SWW4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Med13Q5SWW4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Med13Q5SWW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms