Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ndufaf2Q59J78 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ndufaf2Q59J78 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufaf2Q59J78 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms