Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm12888Q3UW77 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12888Q3UW77 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms