Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-Eb2Q3UUV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms