Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ScimpQ3UU41 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScimpQ3UU41 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms