Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nhlrc4Q3UP44 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nhlrc4Q3UP44 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms