Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem241Q3UME2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem241Q3UME2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms