Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp19Q3UJD6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Usp19Q3UJD6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Usp19Q3UJD6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp19Q3UJD6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms