Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Q3UJC8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Q3UJC8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UJC8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UJC8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Q3UJC8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Q3UJC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UJC8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Q3UJC8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms