Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sf3b2Q3UJB0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sf3b2Q3UJB0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b2Q3UJB0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms