Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud5Q3U2S4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud5Q3U2S4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud5Q3U2S4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud5Q3U2S4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otud5Q3U2S4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otud5Q3U2S4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otud5Q3U2S4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otud5Q3U2S4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms