Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf149Q3U2C5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf149Q3U2C5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms