Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CiartQ3TQ03 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CiartQ3TQ03 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CiartQ3TQ03 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms