Protein–RNA interactions for Protein: Q3B807

Tcerg1l, Transcription elongation regulator 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1lQ3B807 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcerg1lQ3B807 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcerg1lQ3B807 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcerg1lQ3B807 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcerg1lQ3B807 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcerg1lQ3B807 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcerg1lQ3B807 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcerg1lQ3B807 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms