Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna5Q2MKA5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna5Q2MKA5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna5Q2MKA5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms