Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lrriq1Q0P5X1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lrriq1Q0P5X1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Lrriq1Q0P5X1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms