Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf541Q0GGX2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf541Q0GGX2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf541Q0GGX2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms