Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SryQ05738 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SryQ05738 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SryQ05738 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SryQ05738 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SryQ05738 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SryQ05738 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SryQ05738 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SryQ05738 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SryQ05738 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SryQ05738 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SryQ05738 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SryQ05738 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SryQ05738 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SryQ05738 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SryQ05738 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SryQ05738 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SryQ05738 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SryQ05738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms