Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Col9a1Q05722 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Col9a1Q05722 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col9a1Q05722 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms