Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RelbQ04863 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RelbQ04863 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RelbQ04863 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RelbQ04863 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms