Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nme2Q01768 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nme2Q01768 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nme2Q01768 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms