Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atp1b3P97370 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp1b3P97370 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1b3P97370 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1b3P97370 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms