Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmo4P61969 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lmo4P61969 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms