Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdrg1P59048 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdrg1P59048 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdrg1P59048 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms