Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tm6sf1P58749 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tm6sf1P58749 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tm6sf1P58749 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms