Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Setd4P58467 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd4P58467 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd4P58467 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd4P58467 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Setd4P58467 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Setd4P58467 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Setd4P58467 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms