Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snrpa1P57784 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrpa1P57784 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrpa1P57784 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms