Protein–RNA interactions for Protein: P47880

Igfbp6, Insulin-like growth factor-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp6P47880 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Igfbp6P47880 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Igfbp6P47880 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Igfbp6P47880 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Igfbp6P47880 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Igfbp6P47880 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Igfbp6P47880 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Igfbp6P47880 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Igfbp6P47880 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms